پيشرفت علم كمك روز افزوني در پزشكي و بهبود راه‌هاي درماني بسياري از بيماري‌ها داشته است. امروزه ليزر توانسته جايگزين بسياري از اعمال جراحي‌ سنگين و پر عارضه شود. كاربرد ليزر در جراحي فيستول مقعد به دليل حساسيت و آسيب‌پذيري طبيعي ناحيه‌ي مقعد نسبت به ساير اندام‌ها از بسياري از مشكلات اين روند درماني كاسته است. ليزر در تمامي اعمال جراحي از مزاياي بسياري برخوردار است. اما به دليل تك بعدي بودن درمان فيستول مقعد و نبود راهي جز جراحي آن، نقش ليزر پررنگ‌تر و قابل درك‌تر خواهد بود.

در ليزر درماني فيستول مقعد به جاي استفاده از تيغ يا چاقوي جراحي و آسيب زدن به بافت‌هاي اطراف با كمك اشعه و انرژي ساطع شده از دستگاه ليزر مسير فيستول را مي‌بندند. ليزردرماني مي‌تواند با دقت و تهاجم كم‌تر به عضله‌ي دريچه مقعدي و حتي بدون كمترين خونريزي و درد انجام شود. زيرا ليزر اين قابليت را دارد تا هم اعصاب آسيب‌ديده حين جراحي و هم مويرگ‌هاي پاره شده را ترميم كند. اين جراحي سرپايي بوده و نيازي به بي‌هوشي عمومي و تحمل عوارض ناشي از آن ندارد.

درمان فيستول با ليزر در مدت محدودتر و با سرعت بيشتري انجام مي گردد و فرد مي‌تواند زودتر از ساير روش‌ها به فعاليت روزمره و كار خود بازگردد. احتمال عود يا عفونت ناشي از آن كم‌تر از ساير روش‌هاست. نگراني‌اي از عارضه‌‌ي بي‌اختياري مقعدي وجود ندارد، زيرا احتمال آن در اين روش بسيار كاهش مي‌يابد. البته ناگفته نماند ليزر احتمال انتقال بيماري‌هاي منتقل شونده از خون مانند هپاتيت و HIV را به حداقل و حتي صفر مي‌رساند.
با ورود ليزر به حيطه‌ي درماني ترس ناشي از جراحي بيماران و خانواده‌هايشان كم شده و افراد با خيالي آسوده‌تر براي درمان مشكلات خود پا به اطاق عمل مي‌گذارند. پزشكان نيز از اين روش درماني به دليل آساني و كم‌تهاجمي بودن، بيشتر از روش‌هاي قديمي و تيغ جراحي استقبال مي‌كنند.